В сибири нашли новый вариант вируса клещевого энцефалита

В Сибири нашли новый вариант вируса клещевого энцефалита

Фото: sbras.info

Общество / 17 апреля 2018 / 17:26

Новый штамм вируса клещевого энцефалита нашли ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН вместе с коллегами из Института систематики и экологии животных. Новый тип вируса назвали обским. Открытие сделали ученые двух институтов СО РАН, которые много лет изучают геномы и генетику вируса клещевого энцефалита.

В коллекции вирусов, выделенных на территории новосибирского Академгородка они нашли новый. Как пояснили ученые, всего существует три субтипа вируса клещевого энцефалита – восточный, европейский и сибирский. Открытый ученые СО РАН штамм соответствует сибирскому, но отличается от уже известных вариантов вируса генетически. Он близок к границе разделения вирусов на субтипы.

Новый штамм назвали обским. 

«Разница между субтипами составляет 12% по нуклеотидной последовательности, – цитирует «Наука в Сибири» младшего научного сотрудника Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, кандидата биологических наук Сергея Ткачева.

– Оказалось, что новый штамм по своей генетической структуре близок к этой границе: он, конечно, сибирский субтип, но больше остальных похож и на другие типы.

У него уникальная структура белков – точнее, некоторые варианты аминокислотных остатков в них не были описаны ранее, – что может влиять на биологические свойства данного варианта». 

   Ученые Института систематики и экологии животных СО РАН выделили и биологические свойства нового вируса.  По их оценке, он является  слабопатогенным.  Эксперимент на мышах показал, что штамм обладает низкой нейроинвазивностью (способностью проникать в мозг). Его патогенность для человека пока не известна.    Для каждого субтипа существуют прототипные штаммы, они были впервые описаны как соответствующий субтип, и на основе сравнения с ними можно понять, к какому типу относится изучаемый вирус. Считается, что различные субтипы вируса клещевого энцефалита отличаются по симптоматике заболевания. Например, дальневосточный тяготеет к более тяжелой форме клещевого энцефалита, сибирский вызывает хроническую, а европейский является легко переносимым. Впрочем, фактически течение болезни определяют и иные факторы, например, иммунитет. Ученые также проанализировали возраст нового вируса. Они предполагают, что обской клещевой энцефалит, скорее всего, относится к наиболее древней линии среди сибирского субтипа. Обская линия была отделена от общего предка около полутора тысяч лет назад. До этого самой старой считалась балтийская ветка.  «Чтобы узнать возраст новой линии, мы проанализировали полные геномы разных штаммов вируса клещевого энцефалита или их фрагменты, оценили скорость эволюции вируса и затем высчитали, в какой момент времени группа отделилась от предков, – добавил Сергей Ткачев. – Пока на территории ННЦ мы обнаружили только один штамм данной линии. Также нашими коллегами из Москвы были найдены еще два вирусных изолята (выявленных фрагмента генома) в Кемерове, относящихся к Обской линии». 

Ученые подчеркнули, что данные о новом штамме вируса следует учитывать при создании тест-систем и вакцин. При этом ученые все еще не уверены, является ли вакцина, созданная на основе дальневосточного или европейского штамма вируса клещевого энцефалита, в равной степени эффективной против сибирского субтипа.

Источник: http://sibkray.ru/news/1/910206/?sphrase_id=2925232

Сибирские ученые обнаружили новый вариант вируса клещевого энцефалита

Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН совместно с коллегами из Института систематики и экологии животных СО РАН уже много лет изучают геномы и генетику вируса клещевого энцефалита. Не так давно они исследовали коллекцию вирусов, выделенных на территории Новосибирского научного центра: наряду с известными генетическими вариантами вируса был найден новый. 

Существует три субтипа вируса клещевого энцефалита: восточный, европейский и сибирский, который широко представлен в нашем регионе. Недавно обнаруженный вариант (названный «Обским») соответствует последнему из них — правда, генетически «находка» отличается от уже известных вариантов вируса и близка к границе их разделения на субтипы. 

— Разница между субтипами составляет 12 % по нуклеотидной последовательности, — рассказывает младший научный сотрудник ИХБФМ СО РАН кандидат биологических наук Сергей Евгеньевич Ткачев.

— Оказалось, что новый штамм по своей генетической структуре близок к этой границе: он, конечно, сибирский субтип, но больше остальных похож и на другие типы.

У него уникальная структура белков — точнее, некоторые варианты аминокислотных остатков в них не были описаны ранее, — что может влиять на биологические свойства данного варианта. 

В Сибири нашли новый вариант вируса клещевого энцефалита

Ученые ИСиЭЖ СО РАН охарактеризовали новый вирус с точки зрения биологических свойств: по всей видимости, он является слабопатогенным — по крайней мере, для мышей штамм обладает низкой нейроинвазивностью (способностью проникать в мозг). Правда, патогенность для человека пока не известна. 

Для каждого субтипа существуют прототипные штаммы — они были впервые описаны как соответствующий субтип, и на основе сравнения с ними можно понять, к какому типу относится изучаемый вирус.

Кроме того считается, что различные субтипы вируса клещевого энцефалита отличаются по симптоматике заболевания: так, дальневосточный тяготеет к более тяжелой форме клещевого энцефалита, сибирский вызывает хроническую, а европейский является легко переносимым.

Хотя на самом деле течение болезни определяют и особенности зараженного организма — например, иммунитет. 

Оценка возраста вирусов данной группы показала, что они скорее всего относятся к наиболее древней линии среди сибирского субтипа. Обская линия была отделена от общего предка примерно 1,5 тыс. лет назад, что произошло даже раньше Балтийской — до этого она считалась самой старой. 

— Чтобы узнать возраст новой линии, мы проанализировали полные геномы разных штаммов вируса клещевого энцефалита или их фрагменты, оценили скорость эволюции вируса и затем высчитали, в какой момент времени группа отделилась от предков, — добавляет Сергей Ткачев. — Пока на территории ННЦ мы обнаружили только один штамм данной линии. Также нашими коллегами из Москвы были найдены еще два вирусных изолята (выявленных фрагмента генома) в Кемерово, относящихся к Обской линии. 

Так что паниковать из-за наличия нового варианта вируса рано — с учетом того, что у него вряд ли высокая патогенность.

Однако полученные данные имеет смысл учитывать при создании тест-систем (уточняющих принадлежность вируса к определенному субтипу) или даже вакцин.

С другой стороны, у ученых до сих пор нет однозначного вывода о том, является ли вакцина, созданная на основе дальневосточного или европейского штамма вируса клещевого энцефалита, в равной степени эффективной против сибирского субтипа. 

  • Алёна Литвиненко
  • Фото Юлии Поздняковой
  • Поделись с друзьями: 

»

Источник: http://www.sbras.info/articles/science/sibirskie-uchenye-obnaruzhili-novyi-variant-virusa-kleshchevogo-entsefalita

Добрались до Сибири: новосибирские учёные нашли клещей с европейским энцефалитом

Европейский субтип обычно вызывает более лёгкие формы заболевания

Биологи из Новосибирска и Иркутска обнаружили, что среди собранных в Сибири образцов вируса клещевого энцефалита существуют варианты, распространённые в Европе. Об этом сообщает издание «Наука в Сибири».

Специалисты Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН вместе с иркутскими коллегами из Научного центра проблем здоровья семьи и репродукции человека нашли штаммы вируса, которые относятся к европейскому субтипу. Как поясняют исследователи, обычно он вызывает более лёгкие формы заболевания. Всего существует три подтипа: дальневосточный, сибирский и европейский.

Читайте также:  Мазь никофлекс: от чего помогает, инструкция по применению, аналоги, цена, отзывы

«Мы решили разобраться подробно и выяснили интересную вещь: несмотря на то, что некоторые штаммы очень похожи на европейские образцы, они формируют отдельные генетические линии в Западной и Восточной Сибири.

Это интересный факт, но пока не совсем ясно, как этот субтип здесь появился.

Существует гипотеза, что когда-то он был занесён птицами, однако из Европы в Сибирь птицы не мигрируют», — рассказал младший научный сотрудник ИХБФМ СО РАН Сергей Ткачёв.

Как сообщает «Наука в Сибири», учёные новосибирского института исследуют последовательности геномов образцов вируса, взятых у клещей, людей и мелких млекопитающих.

«Вирус распространяется благодаря клещам-переносчикам и животным, которые играют роль природного резервуара, а человек в этой цепи оказывается тупиковой веткой. Специалистам было важно рассмотреть вирус клещевого энцефалита во всех звеньях этой цепи.

Существует теория, что при переходе вируса из организма клеща к животному и назад происходят изменения его генетических свойств, то есть определённые фрагменты генома подвергаются мутациям, и из-за этого меняются биологические свойства», — пишет издание.

Исследование учёных позволит выяснить, как вирус распространяется по Евразии и как он изменяется, а также поможет в диагностике заболевания и создании вакцины.

В конце весны Управление Роспотребнадзора по Новосибирской области сообщило, что, несмотря на холодную погоду в регионе, участились случаи укусов людей клещами. По состоянию на конец мая в области было  зарегистрировано 3378 случаев укусов клещами .

Мы круглосуточно ждём от вас сообщения, фото и видео, связанные с городскими событиями и происшествиями, — присылайте их в любое время через WhatsApp, Viber и Telegram по номеру 8–923–157–00–00, на почту [email protected] или через кнопку «Сообщи свою новость» на нашем сайте. Не забывайте указывать контактный телефон.

Подписывайтесь 

Источник: http://Novosibirsk.BezFormata.com/listnews/novosibirskie-uchyonie-nashli-kleshej/67508708/

Ученые обнаружили новый штамм вируса клещевого энцефалита

Сибирские ученые обнаружили новый вариант вируса клещевого энцефалита и назвали его «Обский». Правда, паниковать, по мнению исследователей, пока рано — скорее всего, он слабопатогенный.

Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН вместе с коллегами из Института систематики и экологии животных СО РАН исследовали коллекцию вирусов клещевого энцефалита, выделенных на территории Новосибирского научного центра.

Кроме известных генетических вариантов вируса, был найден новый — его назвали «Обский», сообщает «Наука Сибири», По словам исследователей, недавно обнаруженный вариант соответствует одному из трех существующих субтипов вируса —  сибирскому, но генетически «находка» отличается от уже известных вариантов и близка к границе их разделения на субтипы.

— Разница между субтипами (восточный, европейский и сибирский — Прим. ред) составляет 12 % по нуклеотидной последовательности, — рассказывает младший научный сотрудник ИХБФМ СО РАН, кандидат биологических наук Сергей Ткачев.

— Оказалось, что новый штамм по своей генетической структуре близок к этой границе: он, конечно, сибирский субтип, но больше остальных похож и на другие типы.

У него уникальная структура белков — точнее, некоторые варианты аминокислотных остатков в них не были описаны ранее, — что может влиять на биологические свойства данного варианта.

 После укуса клеща 14-летний подросток заболел сыпным тифом

Считается, что различные субтипы вируса клещевого энцефалита отличаются по симптоматике заболевания. Так, дальневосточный тяготеет к более тяжелой форме клещевого энцефалита, сибирский вызывает хроническую, а европейский является легко переносимым. Хотя на самом деле, уточняют исследователи, течение болезни определяют и особенности зараженного организма — например, иммунитет. 

 Когда и как в Петербурге сделать прививку от клещевого энцефалита

По словам ученых, новый штамм, по всей видимости, слабопатогенный — на мышах он показал низкую способность проникать в мозг.

Оценка возраста вирусов этой группы показала, что они, скорее всего, относятся к наиболее древней линии среди сибирского субтипа — Обской, которая была отделена от общего предка примерно 1,5 тысячи лет назад.

По словам Сергея Ткачева, пока на территории ННЦ был обнаружен только один штамм этой линии, а коллеги из Москвы нашли еще два вирусных изолята (выявленных фрагмента генома) в Кемерово.

Сколько петербуржцев уже пострадали от клещей в этом году

Источник: https://doctorpiter.ru/articles/19335/

Новый вирус клещевого энцефалита обнаружили ученые Академгородка

Ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН совместно с коллегами из Института систематики и экологии животных СО РАН уже много лет изучают геномы и генетику вируса клещевого энцефалита. Не так давно они исследовали коллекцию вирусов, выделенных на территории Новосибирского научного центра: наряду с известными генетическими вариантами вируса был найден новый, сообщает «Наука в Сибири».

Существует три субтипа вируса клещевого энцефалита: восточный, европейский и сибирский, который широко представлен в нашем регионе. Недавно обнаруженный вариант (названный «Обским») соответствует последнему из них — правда, генетически «находка» отличается от уже известных вариантов вируса и близка к границе их разделения на субтипы. 

— Разница между субтипами составляет 12 % по нуклеотидной последовательности, — рассказывает младший научный сотрудник ИХБФМ СО РАН кандидат биологических наук Сергей Евгеньевич Ткачев.

— Оказалось, что новый штамм по своей генетической структуре близок к этой границе: он, конечно, сибирский субтип, но больше остальных похож и на другие типы.

У него уникальная структура белков — точнее, некоторые варианты аминокислотных остатков в них не были описаны ранее, — что может влиять на биологические свойства данного варианта. 

Ученые ИСиЭЖ СО РАН охарактеризовали новый вирус с точки зрения биологических свойств: по всей видимости, он является слабопатогенным — по крайней мере, для мышей штамм обладает низкой нейроинвазивностью (способностью проникать в мозг). Правда, патогенность для человека пока не известна. 

Для каждого субтипа существуют прототипные штаммы — они были впервые описаны как соответствующий субтип, и на основе сравнения с ними можно понять, к какому типу относится изучаемый вирус.

Кроме того считается, что различные субтипы вируса клещевого энцефалита отличаются по симптоматике заболевания: так, дальневосточный тяготеет к более тяжелой форме клещевого энцефалита, сибирский вызывает хроническую, а европейский является легко переносимым.

Хотя на самом деле течение болезни определяют и особенности зараженного организма — например, иммунитет. 

Оценка возраста вирусов данной группы показала, что они скорее всего относятся к наиболее древней линии среди сибирского субтипа. Обская линия была отделена от общего предка примерно 1,5 тыс. лет назад, что произошло даже раньше Балтийской — до этого она считалась самой старой. 

— Чтобы узнать возраст новой линии, мы проанализировали полные геномы разных штаммов вируса клещевого энцефалита или их фрагменты, оценили скорость эволюции вируса и затем высчитали, в какой момент времени группа отделилась от предков, — добавляет Сергей Ткачев. — Пока на территории ННЦ мы обнаружили только один штамм данной линии. Также нашими коллегами из Москвы были найдены еще два вирусных изолята (выявленных фрагмента генома) в Кемерово, относящихся к Обской линии. 

Так что паниковать из-за наличия нового варианта вируса рано — с учетом того, что у него вряд ли высокая патогенность.

Читайте также:  Немозол: инструкция по применению, цена, аналоги, от чего (таблетки 200 мг и 400 мг, суспензия)

Однако полученные данные имеет смысл учитывать при создании тест-систем (уточняющих принадлежность вируса к определенному субтипу) или даже вакцин.

С другой стороны, у ученых до сих пор нет однозначного вывода о том, является ли вакцина, созданная на основе дальневосточного или европейского штамма вируса клещевого энцефалита, в равной степени эффективной против сибирского субтипа. 

Источник: https://academ-online.ru/2018/04/18/novyy-virus-kleshchevogo-encefalita-obnaruzhili-uchenye-akademgorodka

Открыт новый вирус клеща

Он локализуется в Эхирит-Булагатском районе и очень опасен для человека

Приангарье давно заслужило славу региона, богатого на клещей. Каждый год с наступлением тепла насекомые активизируются и начинают свою жестокую атаку на человека. Количество клещей с каждым годом не уменьшается, но и не увеличивается — хотя бы это радует.

Число опасных болезней, переносчиками которых являются клещи, также остается неизменным. Самыми распространенными являются клещевой энцефалит, боррелиоз и риккетсиоз.

Совсем недавно ученые Института эпидемиологии и микробиологии Научного центра проблем здоровья семьи и репродукции человека Сибирского отделения РАМН открыли новый тип вируса клещевого энцефалита.

От нового вируса уже умер человек

— Клещевой энцефалит существует трех видов — дальневосточный, это очень тяжелый вирус, примерно 30% заразившихся им умирают; урало-сибирский — смертность составляет 1—2% от общего числа заболевших; европейский — это слабый вирус, — рассказывает Юрий Джиоев, кандидат биологических наук, старший научный сотрудник лаборатории генетической диагностики Института эпидемиологии и микробиологии. — Все эти три варианта вируса клещевого энцефалита присутствуют в нашем регионе. В чем опасность этого вируса? Он попадает в кровь, затем в мозг, где начинает разрушать клетки. В результате у человека могут отказать руки, ноги, наступить полный паралич тела, болезнь может привести и к летальному исходу.

Недавно в Эхирит-Булагатском районе мы обнаружили новый вариант вируса клещевого энцефалита, по своей генетической природе он близок к дальневосточному, самому опасному вирусу.

Иркутским ученым удалось расшифровать генетическую структуру вируса. Кроме Эхирит-Булагатского и соседнего с ним Баяндаевского районов он был выявлен в Бурятии, а также за рубежом — в Монголии, где от него на 11-й день после укуса умер один человек.

— Это новый вариант вируса клещевого энцефалита, скорее всего очень опасный. Он может приводить к тяжелым формам инвалидности, а возможно, и к смертельным случаям, — подчеркивает Юрий Джиоев. — Его возможную опасность мы вычислили, когда полностью расшифровали его генетическую структуру, на это у нас ушло почти два года.

Похожие на этот тип вирусы мы обнаружили в Бурятии, Бичурском районе и Читинской области. Вариантов, как этот вирус, сходных по действию с дальневосточным, оказался на нашей территории, несколько.

Может быть, он был занесен с птицами, которые мигрируют с Дальнего Востока через Байкал; возможно, произошла генная мутация вирусов, связанная с прохождением через наш край облака от ядерного взрыва в Семипалатинске.

Биочип нам поможет

Именно тяжелая и опасная ситуация, связанная с большой численностью клещей, и заставила иркутских и российских ученых (группа насчитывает более 30 человек) искать новые способы диагностики болезней, переносчиками которых и являются эти насекомые.

— В одном клеще запросто могут уживаться 2—3 инфекции. Известны случаи, когда человек заболевал не только клещевым энцефалитом, но одновременно и другими болезнями. В этом случае опасность для организма, конечно, усиливается, — говорит Юрий Павлович.

— Нам удалось разработать биочип, который может быстро и эффективно выявлять возбудителей, заражающих человека при укусах клещей. Это относительно несложное устройство, но на его изобретение у нас ушло несколько лет.

Вадим Анненков, сотрудник Лимнологического института, создал особое нанопокрытие из молекул, на которое наносятся другие специальные молекулы — зонды. Затем мы берем клеща, выделяем из него генетический материал и наносим его на специальную лунку.

Наблюдение под ультрафиолетовым микроскопом позволяет понять, является ли клещ носителем болезней либо нет.

В чем несомненное преимущество этого метода — он позволяет быстро и одновременно эффективно выявить все три опасные для человека инфекции, если они присутствуют в клеще, — энцефалит, боррелиоз и риккетсиоз.

Сейчас используются в основном два метода диагностики этих болезней — ПЦР-диагностика и иммуноферментный анализ клеща и крови человека. Оба метода неидеальны, допустимы небольшие погрешности в постановке диагноза, и самое главное — анализы на возбудителей занимают несколько часов.

А в случае с клещевым энцефалитом ранняя диагностика очень и очень важна — чем раньше начинается лечение в случае подтверждения диагноза, тем более благоприятен прогноз выздоровления человека.

— У нас пока есть лишь лабораторный образец биочипа, мы планируем еще работать над ним, совершенствовать, чтобы определять и большее количество инфекций (клещ переносит до семи наименований инфекционных заболеваний, опасных для человека), и делать это еще быстрее и качественней. В дальнейшем таким образом можно будет диагностировать и другие инфекции — гепатиты, грипп, японский энцефалит, СПИД, для этого потребуется лишь заменить молекулы-зонды в биочипе. Главное — знать генетическую структуру вируса или бактерии.

Такой метод диагностики болезней намного дешевле, быстрее и проще, чем те, что существуют сегодня. Прежде чем внедрить биочип, изобретение нужно запатентовать, найти деньги на его массовое производство. Пока ученые, как говорится, работают на голом энтузиазме. Был выигран грант по федеральной программе развития нанотехнологий, но выделенные деньги пока заморожены.

Как поймать вирус?

На таком же энтузиазме ученые под руководством Юрия Джиоева разрабатывают технологию, как можно находить и ликвидировать вирус непосредственно в клетках.

— Пока вирус, например, клещевого энцефалита находится в крови, его можно поймать, остановить его распространение. Если же вирус начал размножаться в клетке, делиться, вылечить человека практически бывает очень трудно, нет еще лекарств для таких случаев.

Член нашей команды Борис Сухов и его коллеги из Иркутского института химии изобрели наноконтейнер из молекул, который может проникать в клетку. Мы работаем над созданием препарата-наноконтейнера, содержащего специальные молекулы-зонды против вируса, которые доставлялись бы внутрь зараженной клетки и тормозили или прекращали размножение вируса.

Таким образом, заразившийся человек будет спасен. Такой препарат практически безвреден для организма, вводить его мы планируем с помощью инъекций либо обычных капсул.

Клеща будут исследовать круглосуточно

По словам врачей, пока самым эффективным способом защиты от опасных насекомых является вакцинация.

Причем если раньше прививки рекомендовали делать до начала весенне-летнего сезона, то сейчас введены новые правила — вакцину можно ввести в любое время года.

Тем же, кто прививаться по каким-либо причинам не желает, врачи рекомендуют пользоваться средствами защиты от клещей, они продаются в специализированных магазинах и аптеках. Стоимость — от 70 до 200 рублей.

— Когда приходит покупатель, он обычно просит репеллент от клещей.

Но надо пояснить, что репеллент — это отпугиватель насекомых, а в целом средства защиты от клещей делятся на три вида — непосредственно репелленты, которые отпугивают клещей, акарицидные, которые убивают насекомое, и инсектицидно-репеллентные, это препараты комбинированного действия, то есть они и отпугивают, и убивают клещей, — рассказывает продавец-консультант магазина, специализирующегося на дезинфекции. — Обычно спрашивают «Дэту» или «Фумитокс», мы объясняем разницу.

Читайте также:  Имудон: инструкция по применению, цена, отзывы, аналоги, от чего (таблетки) для детей

«Дэта» и «Рефтамид Максимум» отпугивают клеща, но не лишают его активности.

А вот «Рефтамид Таежный», «Фумитокс», «Гардекс» обладают нервно-паралитическим действием; даже если клещ пристанет к одежде, то, пораженный действием препарата, отпадет уже через несколько минут.

К препаратам третьей группы относятся известный «Москитол-антиклещ» и «Кра-реп», в них содержится два действующих вещества, которые и оберегают человека от укусов насекомых. Для детей существуют специальные средства, которые можно наносить на кожу ребенка.

— Не забывайте как можно чаще осматриваться на природе, клещи сейчас голодные, а потому очень активные, агрессивные, — напутствует Юрий Джиоев. — Помните, что клещи любят укромные места — область шеи, груди, паха, подмышечные впадины; кожа здесь тоньше, присосаться ему легче.

Если он укусил

Если же сберечься от укуса насекомого не удалось, следует немедленно принять меры — клеща удалить, завернуть во влажную марлю или тряпочку и везти на анализ. Стоимость его в этом году составляет 440 рублей. Начиная с ближайших выходных, в Институте эпидемиологии и микробиологии принимать насекомых на анализ будут круглосуточно.

Источник: http://baik-info.ru/sm/2009/16/009001.html

Европейский вариант вируса клещевого энцефалита обнаружили сибирские ученые

07.06.2018, 11:10

Исследования новосибирских и иркутских биологов показали, что среди образцов вируса клещевого энцефалита, собранных в Сибири, существуют варианты, относящиеся к субтипу, распространенному в Европе. Обычно он вызывает более легкие формы заболевания. Специалисты Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН давно сотрудничают с коллегами из Научного центра проблем здоровья семьи и репродукции человека (Иркутск) в изучении клещевого энцефалита. В Иркутске существует большая коллекция вирусов, которые были собраны в разных регионах Евразии, – важно было охарактеризовать их современными генетическими методами. Всего выделяют три субтипа вируса клещевого энцефалита: дальневосточный, сибирский и европейский — они названы по местам выделения прототипных штаммов. Однако работы ученых показали, что разные формы этого вируса можно обнаружить практически на всей территории Евразии. Так, в нашем регионе существуют и штаммы, относящиеся к европейскому субтипу.

– Мы решили разобраться подробно и выяснили интересную вещь: несмотря на то, что некоторые штаммы очень похожи на европейские образцы, они формируют отдельные генетические линии в Западной и Восточной Сибири, – рассказал младший научный сотрудник ИХБФМ СО РАН Сергей Ткачёв. – Это интересный факт, но пока не совсем ясно, как этот субтип здесь появился. Существует гипотеза, что когда-то он был занесен птицами, однако из Европы в Сибирь птицы не мигрируют.

Специалисты ИХБФМ СО РАН определяли последовательности геномов образцов вируса, взятых у клещей, а также у больных людей и мелких млекопитающих, например сусликов. Этот вирус распространяется благодаря клещам-переносчикам и животным, которые играют роль природного «резервуара», а человек в этой цепи оказывается тупиковой веткой.

Существует теория, что при переходе вируса из организма клеща к животному и назад происходят изменения его генетических свойств, то есть определенные фрагменты генома подвергаются мутациям, и из-за этого меняются биологические свойства. Однако это специалистам только предстоит выяснить: по понятным причинам изучение таких цепей сложно.

– Подобные исследования – это, с одной стороны, фундаментальная задача: они позволяют выяснить, как вирус распространялся по территории Евразии, какова его история и как он изменяется, – отмечает Сергей Ткачёв. – Возможно, нам удастся связать биологические свойства клещевого энцефалита с его генетикой.

С другой стороны, работа в этом направлении важна для практических целей, так как исследования генетической вариабельности помогают при создании диагностических систем, выявляющих различные варианты вируса, а в дальнейшем, возможно, и вакцин.

Источник: Наука в Сибири

Источник: https://www.navigato.ru/novosti/publication/evropeiskii-variant-virusa-kleshevogo-encefalita-obnarujili-sibirskie-uchenie

В сибири обнаружен новый вариант клещевого энцефалита

Ученые из Института химической биологии и фундаментальной медицины и Института систематики и экологии животных Сибирского отделения РАН изучили коллекцию вирусов, выделенных на территории Новосибирского научного центра.

Среди их находок — новый штамм (и даже, возможно, субтип) вируса, отличающийся от ранее известных примерно на 12 процентов от общего объема нуклеотидной последовательности.

По всей видимости, он древнейший из своих «собратьев», сообщает «Наука в Сибири».

До недавних пор было известно всего три субтипа (подтипа) вируса клещевого энцефалита: восточный, европейский и сибирский. Вновь найденный штамм, получивший название «обский», ближе всего к последнему из них, сибирскому.

Однако генетически «находка» отличается от уже известных вариантов вируса и близка к границе их разделения на субтипы. Разница между субтипами составляет от 12 процентов нуклеотидной последовательности, и новый штамм почти пересекает этот раздел.

Он словно «мостик» между всеми тремя субтипами вируса клещевого энцефалита.

Есть у нового штамма и то, что отличает его от всех известных. В частности, некоторые варианты аминокислотных остатков его белков не были описаны ранее, то есть являются уникальными. Состав белков вируса часто напрямую влияет на его способность эффективно прикрепляться к клеткам, проникать через гемато-энцефалический барьер и в целом определяет его опасность для человека.

Ученые Института систематики и экологии животных Сибирского отделения РАН дополнительно исследовали новый вирус в лаборатории.

Для мышей штамм оказался не очень опасным, более «мягким», чем его сородичи: в мозг он проникал хуже, а именно нейроинвазивность определяет способность клещевого энцефалита нанести ущерб здоровью своих жертв.

На людях опыты, естественно, не проводились, и патогенность нового штамма для человека остается неизвестной.

Далее исследователи проанализировали полные геномы разных штаммов вируса клещевого энцефалита или их фрагменты, оценили скорость эволюции вируса (скорость накопления изменений в его ДНК) и затем высчитали, в какой момент времени «обский» вариант отделился от предков. Выяснилось, что он относится к наиболее древней линии среди сибирского субтипа. Эта линия была отделена от общего предка примерно полторы тысячи лет назад — даже раньше, чем «балтийская», до этого считавшейся самой старой.

Поиск и изучение новых разновидностей вируса клещевого энцефалита имеет большое прикладное значение. Скажем, дальневосточный субтип вызывает более тяжелую форму клещевого энцефалита, сибирский — хроническую, а европейский — наиболее легкую (впрочем, тяжесть заболевания заметно зависит и от иммунитета каждого конкретного заболевшего).

Понимание того, какой именно субтип вируса распространен на той или иной территории, поможет врачам более уверенно прогнозировать течение болезни и заранее принимать меры, способствующие наилучшему исходу.

У ученых до сих пор нет однозначного вывода о том, является ли вакцина, созданная на основе дальневосточного или европейского штамма вируса клещевого энцефалита, достаточно эффективной против сибирского субтипа.

Впрочем, ученые полагают, что паниковать из-за открытия нового варианта вируса рано — у него вряд ли высокая патогенность. Однако полученные ими данные имеет смысл учитывать при создании тест-систем, уточняющих принадлежность вируса к определенному субтипу, или даже вакцин, предупреждающих заболевание клещевым энцефалитом в этой части страны.

Источник: https://nauka.tass.ru/nauka/6818295

Ссылка на основную публикацию
Adblock
detector